国家对合作社的惠农政策多杂，按照惠农政策的涵盖范围及其特点，这些政策可以三大类：优惠政策、补贴类政策、专项扶持类政策。
优惠政策：合作社可以享受土地流转补贴、税收减免、用水用电优惠等优惠政策。
补贴类政策：国家给予农业企业或合作社贷款补贴、购机补贴、种粮补贴及农资综合补贴等。主要的农业补贴有：种粮直补、农资综合补贴、生猪标准化规模养殖场建设、农业保险补贴、粮食最低收购政策、退耕还林补贴、草原生态保护补助等等。
专项扶持：国家为扶持某些产业拿出专项资金，扶持资金力度大，覆盖范围相对较小，需要在项目通知后申报争取。
我国专项扶持比较多，比如：农业综合开发贷款贴息项目，要求单笔贷款不低于100万，不高于6000万。农业综合开发产业化经营项目、土地治理项目，扶持资金80-160万。
